Im Chor standen ursprünglich die heute in den Seitenschiffen aufgestellten Chorgestühle der Stiftsherren. Herzog Ulrich, der Württemberg reformierte, bestimmte den Chor 1550 zur württembergischen Familiengrablege. Die 14 steinernen Grabmale der bis 1593 verstorbenen württembergischen Herzöge und deren Angehörigen sind heute dort zu besichtigen. Unter dem Lettner ist der Flügelaltar des Nördlinger Künstlers und Dürer-Schülers Hans Leonhard Schäufelein zu sehen.
Zur kostbarsten Ausstattung gehören die zwischen 1476 und 1480 in der Straßburger Werkstatt von Peter Hemmel von Andlau gestalteten Glasfenster. Goethe schrieb über die Scheiben: „Die Hauptfarben sind alle da, und zwar in ihrer höchsten Energie und Sattheit.” Vom Chor aus ist der Zugang zum Turm möglich, von dem sich ein Einblick in die Altstadtgassen Tübingens und ein herrlicher Ausblick in die Umgebung eröffnet.
Die Stiftskirche Tübingen kann während Gottesdiensten und Konzerten nicht besichtigt werden. Chor und Turm sind im Winterhalbjahr geschlossen.
Kirche geöffnet täglich 9.00–17.00 Uhr, Turm und Grablege von Ostern bis Erntedank Fr u. So 13.00–17.00 Uhr u. Sa 11.00–17.00 Uhr, in den Sommerferien täglich, außer Mo 13.00–17.00 Uhr
